Oprogramowanie
Działający na Androidzie 10 z Magic UI 3.1, Honor 9S zapewnia użytkownikowi nowoczesny interfejs. Brakuje mu jednak usług Google Play, co może być przeszkodą dla użytkowników, którzy w dużym stopniu polegają na ekosystemie Google. Zamiast tego użytkownicy polegają na AppGallery Huawei i sklepach z aplikacjami innych firm, aby pobierać aplikacje.